尽管很多爸爸妈妈对自身小孩男性生殖器的尺寸都很关注，但事实上小阴茎并不普遍。严苛地说，小阴茎是在试管胚胎中产生的，它具体表现为尺寸的出现异常，而并不是样子的出现异常。小阴茎的男性尿道口部位是一切正常的，可区别男性生殖器的头顶部和体部;睾丸的大小可能是一切正常的。小阴茎的发病原因尚不清楚，但是有时候好像与怀孕后第4～9月期内雄性激素代谢不够相关。
小阴茎是指阴茎伸展长度小于相同年龄或相同性发育正常状态人群的阴茎长度平均值2.5个标准差以上者，但解剖结构和外观形态正常。国人成年男性阴茎静态长度平均约5?6cm，牵拉长度平均约11?13cm。一般认为，成人阴茎松软时<4cm，牵拉长度<9.5cm，即为阴茎短小。对于小儿，拉长的阴茎长度<平均值加上2.5个标准差可诊断为小阴茎。
由于小阴茎将会对发展中的少年儿童导致心理状态上的危害，因而部分运用1%的睾酮素霜治疗约3～6月，是—种可用的方式，此类治疗常可使男孩子发育到中等水平尺寸。假如此方式功效不满意，则可考虑到肠胃外给与睾酮素治疗3月;据汇报，那样解决可推动阴茎生长，而仅有短暂性的推动人体骨骼生长发育功效及轻微的男性化功效。殊不知，理应明确指出，在童年期应尽量减少应用过多的雄性激素，由于雄性激素治疗造成的骨髋太早痊愈将会会限定之后的长骨生长发育。Money和Mazur二氏近期汇报，运用幼时型可弯折的塑胶男性生殖器给一名9岁的小阴茎病人嵌入取得成功。这一手术治疗已使该患者可以站起小便，因此使其提高了自尊。
在一些状况下，小阴茎也可出現于别的疾病中，这种疾病主要表现为下丘脑垂体或脑垂体的出现异常(比如无脑畸形，先天脑垂体缺损，Prader-Willi氏综合征，Kallman氏综合征和Meckel氏综合征)或者睾丸异常，或者染色体变异;而另一些小阴茎患者也由此可见于身心健康宝宝。
因为青春发育期一切正常的睾酮素代谢能推动男性生殖器的生长发育，因而，假如老年期依然主要表现为小阴茎，则体现了病人身体潜在性的雌激素混乱。假如确认确定有睾酮素欠缺，则肠胃外给与睾酮素将会有一定功效。殊不知，大部分关注自身阴茎大小的男性，其男性生殖器在解剖学上全是一切正常的。在一些状况下，因为肥胖症或睾丸肿胀，男性生殖器将会看起来不大，但这并不是这节中常说的“小阴茎”。除非是的确是小阴茎，男性生殖器的尺寸一般不容易对男性性功能导致危害危害。但是，这些对阴茎大小太过担忧的人(包含男性和女士)，则很可能因为担忧而产生性生活艰难。
